Начало работы¶
Выберите способ использования OpenBioMaps¶
Чтобы создать проект OpenBioMaps, необходим доступ к серверу OpenBioMaps. Это может быть ваш собственный или арендованный сервер либо уже обслуживаемый кем-либо сервер, на котором размещаются проекты OpenBioMaps.
Присоединитесь к существующему серверу¶
Самый простой способ создать новый проект, иногда также называемый базой данных, — воспользоваться существующим сервером OpenBioMaps. Просмотрите список известных серверов, чтобы узнать, есть ли у вас доступ к одному из них. Существуют специализированные публичные серверы, на которых размещается множество различных баз данных.
Настройте собственный сервер¶
Если вам требуется больше ресурсов или вы хотите контролировать доступ ко всему серверу, можно установить собственный сервер OpenBioMaps.
Установка сервера OpenBioMaps
Инструкции по установке с использованием Docker:
Установка Docker
Создайте проект OpenBioMaps¶
На одном сервере OpenBioMaps может размещаться несколько проектов баз данных. Перед созданием проекта необходим доступ к уже существующему проекту на сервере. После получения доступа можно создать и настроить проект в соответствии с требованиями вашего процесса сбора данных.
Необходимые шаги описаны в руководстве здесь: https://openbiomaps.org/documents/en/tutorials.html#new-project, и здесь: https://openbiomaps.org/documents/en/new_project.html
Изучите модель данных наблюдений¶
Прежде чем проектировать базу данных и формы сбора данных, полезно понять, как OpenBioMaps представляет наблюдения за биоразнообразием.
События наблюдений и отдельные наблюдения
Настройте данные¶
После создания проекта необходимо определить структуру данных и способ их сбора.
OpenBioMaps позволяет создавать таблицы и поля базы данных, относящиеся к конкретному проекту, и управлять ими. Структура базы данных должна соответствовать информации, которую требуется регистрировать, а также связям между различными типами данных.
Определите структуру базы данных¶
Управление таблицами проекта и их столбцами осуществляется через административный интерфейс. Зарегистрированные в нём таблицы и поля становятся доступны в интерфейсах OpenBioMaps и могут использоваться для запросов и сбора данных.
Рекомендуется добавлять описания таблиц и полей. Эти описания являются частью метаданных проекта и помогают пользователям понять смысл данных и их предполагаемое назначение.
Административные настройки
Создайте формы сбора данных¶
После определения структуры базы данных можно создавать формы загрузки для ввода и сбора данных.
Форма загрузки определяет, какие поля доступны пользователям, какие из них обязательны, каким образом вводятся значения и как осуществляется сбор данных. Формы можно использовать для ввода данных через веб-интерфейс, загрузки файлов и доступа через API.
Управление формами загрузки
Структура базы данных и формы сбора данных вместе определяют основной процесс сбора данных в проекте OpenBioMaps.
Управление данными и доступ к ним¶
До начала сбора данных продумайте, как будет осуществляться управление данными и контролироваться доступ к ним.
Доступ к данным
Политика управления данными
Подключитесь к проекту¶
Доступ к проектам OpenBioMaps можно получить через несколько интерфейсов и инструментов в зависимости от способа сбора, управления или анализа данных.
Веб-интерфейс¶
Веб-интерфейс — основной инструмент управления проектом OpenBioMaps. Он предоставляет инструменты для управления данными и пользователями, конфигурации и администрирования.
Интерфейс пользователя
Административный интерфейс
OpenBioMaps также предоставляет программные интерфейсы для внешних клиентских приложений.
API OpenBioMaps
Интеграция с QGIS¶
Плагин OpenBioMaps для QGIS предоставляет доступ к данным OpenBioMaps из QGIS.
Пакет R¶
Пакет obm для R предоставляет инструменты для доступа к данным OpenBioMaps
и работы с ними в R.
Другие интеграции¶
Appsmith, Nextcloud — требуется что-то ещё?
Начните сбор данных и управление ими¶
Теперь проект OpenBioMaps готов к сбору данных.
В зависимости от вашего рабочего процесса данные можно вводить через веб-интерфейс, загружать из файлов, собирать с помощью мобильных приложений или передавать через API OpenBioMaps.
После добавления данных в систему их можно проверять, обрабатывать, запрашивать, визуализировать, анализировать и предоставлять в общий доступ в соответствии с процессом управления данными и правилами проекта.
Информацию о конкретных процессах сбора данных см. в разделе Примеры сбора данных в OpenBioMaps.