- Bevezetés
- Útmutatók
- Felhasználói felületek
- API dokumentáció
- Új OBM szerver telepítési útmutató
- PWA alkalmazás
- Mobil alkalmazás dokumentáció
- Fejleszői információk
- Gyakran Ismételt Kérdések
- Mi az OpenBioMaps?
- Mi az OpenBioMaps konzorcium?
- Hogyan léphetek kapcsolatba a konzorciummal?
- Hogyan tudok saját adatbázist projektet készíteni/alapítani?
- Hogyan tudok adatot feltölteni?
- Hogyan férhetek hozzá az adatokhoz?
- Hogyan tudok regisztrálni egy OpenBioMaps adatbázis proejektbe?
- Van programozható felület fejlesztőknek?
- Milyen nyelvek támogatottak?
- Hogyan tudok hozzájárulni az OpenBioMaps-hoz?
- Kell fizetni valamiért?
- Hol és hogyan tárolja az OpenBioMaps az adatokat?
- Van valamilyen biztonsági mentés megoldás?
- Elfelejtettem a jelszavamat, most mi lesz?
- Rózsaszín négyzetek vannak a térkép helyén
- Mi az a RUM?
- Lehetséges DOI-t rendelni az adatbázisokhoz?
- Hol találom meg az OpenBioMaps szerverek listáját?
- Hogyan használható az OpenBioMaps mobilalkalmazás?
- Hol található meg az OpenBioMaps R csomag?
- Milyen adat letöltési lehetőségek vannak?
Gyakran Ismételt Kérdések¶
Mi az OpenBioMaps?¶
Az OpenBioMaps egy szoftver- és szolgáltatási platform a biológiai adatok kezelésére. Önállóan vagy szolgáltatásként is használható. Olyan adatbázis-alapú projektek létrehozására használható, amelyeket egyszerre több, különböző eszközökkel és hozzáférési jogosultsági szintekkel rendelkező felhasználó is használhat. Ha nem kíván saját szervert fenntartani, szolgáltatásként is használhatja, mivel egyes intézmények olyan szervereket is üzemeltetnek, amelyeken kutatási vagy civil tudományos projektek ingyenesen működnek.
Mi az OpenBioMaps konzorcium?¶
Az OpenBioMaps konzorciumot közintézmények és civil szervezetek hozták létre 2015 szeptember elsején. A konzorcium célja, hogy az OpenBioMaps szotfevereket fejlessze és arra épülő szabadon hozzáférhető szolgáltatásokat üzemeltessen. A konzorcium tagjai egyenlő partnerek, akik valamilyen módon hozzájárulnak mind a fejlesztéshez mind a működtetéshez. A konzorciumhoz bárki csatlakozhat, aki elfogadja az OpenBioMaps alaptételeit, eleget tesz annak kitételének és a már jelenlegi konzorciumi partnerek elfogadják a belépését.
Jelenlegi OpenBioMaps partnerek:
Debreceni Egyetem
kapcsolat: Dr. Bán Miklós
Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság
kapcsolat: Baranyai Zsolt
Eötvös Loránd Tudományegyetem
kapcsolat: Ritter Dávid
WWF Magyarország
kapcsolat: Sipos Katalin
Eszterházy Károly Egyetem
kapcsolat: Dr. Pénzesné Kónya Erika
Milvus Csoport Egyesület
kapcsolat: Papp Edgár
Duna-Dráva Nemzeti Park Igazgatóság
kapcsolat: Gáborik Ákos
Fertő-Hanság Nemzeti Park Igazgatóság
kapcsolat: Takács Gábor
Az OpenBioMaps konzorcium nyilatkozata itt elérhető.
Hogyan tudok saját adatbázist projektet készíteni/alapítani?¶
Ha már tagja egy szerveren lévő projektnek, akkor a webes felület segítségével új adatbázis-projektet alapíthat ugyanazon a szerveren. Ez egy űrlap kitöltéssel elvégezhető egyszerű folyamat.
Hogyan tudok adatot feltölteni?¶
Egyszerű válasz: adatfeltöltési űrlapok használatával. Vagy esetleg bármilyen PostgreSQL kliens használatával, bár ez a megoldás csak nagy mennyiségű adat alkalmi importálásához ajánlott.
Hogyan férhetek hozzá az adatokhoz?¶
A webes felületen keresztül térképes vagy szöveges lekérdezésekkel.
PostgeSQL kliens segítségével.
Az OpenBioMaps R csomag használatával.
A webes felületen keresztül történő adatmegosztás használatával.
Adatexporttal a webes felületen keresztül.
Hogyan tudok regisztrálni egy OpenBioMaps adatbázis proejektbe?¶
A regisztrációhoz meghívás szükséges. Bármely regisztrált tag meghívhat új felhasználókat. Ezen kívül alapértelmezetten rendelkezésre áll a bejelentkezési felületről egy meghívó igénylő űrlap, aminek a kitöltésével új felhazsnálók igényelhetnek meghívót egy projekthez való csatlakozáshoz. Továbbá létezik egy OpenID modul, amely lehetővé teszi Google fiókkal való regiszráviót és bejelentkezést.
A regisztrációval és a meghívásokkal kapcsolatos további információkért kérjük, forduljon a csatlakozni kívánt adatbázis létrehozóihoz vagy adminisztrátoraihoz.
Van programozható felület fejlesztőknek?¶
Igen. A projektadat-szolgáltatás (PDS) lehetővé teszi a projektek és a felhasználói adatok lekérdezését projektenként, az adatbázisokból érkező URL-kéréseken keresztül.
Példa: https://openbiomaps.org/pds.php?scope=get_project_list
További információkért látogasson el az API dokumentációba.
Milyen nyelvek támogatottak?¶
Nincsenek nyelvi korlátozások, de az OpenBioMaps jelenleg magyar, angol, román, spanyol és részben orosz nyelven érhető el. További nyelvek vagy fordítások a https://translate.openbiomaps.org felületen keresztül adhatók hozzá.
Minden projektnek egyéni nyelvi beállításai és a hozzá tartozó fordítások lehetnek.
Hogyan tudok hozzájárulni az OpenBioMaps-hoz?¶
Adatbázis-projekt létrehozásával/alapításával
Adatok feltöltéséval adatbázis-projektbe
Új OpenBioMaps szerver létrehozásával
Adatbázisok hosztolásával a szervereden
Új nyelvek hozzáadásával vagy meglévő fordítások javításával
Szoftverfejlesztéssel
Pénzügyi támogatással
Kell fizetni valamiért?¶
Az OpenBioMaps minden összetevője és szolgáltatása teljesen ingyenes, de a fejlesztések egy része nem önkéntes munka, azaz fizetünk a fejlesztőknek így minden támogatást köszönettel fogadunk a fejlesztéshez!
Hol és hogyan tárolja az OpenBioMaps az adatokat?¶
Minden OpenBioMaps szerver a saját adatbázisában és fájlrendszerében tárolja az adatokat.
Van valamilyen biztonsági mentés megoldás?¶
Nincs központosított biztonsági mentés, mivel az OpenBioMapsban nincs központosított adatkezelés. Minden szerver saját biztonsági mentési megoldással rendelkezik, de néhány szerver egymás tárolókapacitását használja archiválásra.
Elfelejtettem a jelszavamat, most mi lesz?¶
Ne aggódj, nagyon könnyű új jelszót szerezni.
Kövesse a bejelentkezési oldalon található “Elveszett jelszó” linket.
Ott megadhatja a bejelentkezési e-mail címét. Miután elküldte, kap egy e-mailt a rendszertől, amely tartalmaz egy linket, amelyet követve bejelentkezhet a fiókjába, és beállíthat egy új jelszót.
Rózsaszín négyzetek vannak a térkép helyén¶
Ennek az oka valamilyen konfigurációs hiba lehet, amely a térképi rétegekkel vagy az adatkérések beállításaival függhet össze.
Mi az a RUM?¶
A RUM egy angol nyelvű akroním ami a projekt nyitottságát fejezi ki magyarul OFM lenne.
Read Upload Modify magyarul Olvasás Feltöltés Módosítás
Minden eleme - 0 + értékű lehet.
ahol
[-] zárt, [0] részben nyitott [+] publikus
a hozzá kapcsolódó színek pedig: - fekete 0 piros + zöld
például:
R U M: részben nyitott olvasásra, szabadon elérhető feltöltésre és zárt a módosításra.
Lehetséges DOI-t rendelni az adatbázisokhoz?¶
Igen, minden véglegesített állapotú adatbázis kaphat DOI-t a DataCite DOI szolgáltatás segítségével.
Minden adatbázisnak van egy DOI metaadat oldala, mint például:
https://dinpi.openbiomaps.org/projects/danubefish/index.php?metadata
DOI-előtagunk a DataCite-ban: 10.18426
A DOI utótagok automatikusan generálódnak és egyediek.
Minden adatbázisban lehetőség van további DOI-kat rendelni egyes adatkészletekhez.
Hol találom meg az OpenBioMaps szerverek listáját?¶
A regisztrált szerverek egy OpenBioMaps adatbázisában találhatók a https://openbiomaps.org/projects/openbiomaps_network címen.
Hogyan használható az OpenBioMaps mobilalkalmazás?¶
Iphone-on vagy Androidon (jelenleg csak az Androidos verzió működik). A felhasználóknak be kell jelentkezniük a saját szerverükön kersztül, hogy érhessék a projektükben rendelkezésre álló adatfeltöltő űrlapokat. A bejelentkezés és az űrlapok letöltése után az alkalmazás offline is használható. A jelenlegi alaptérkép Google alapú, amely csak akkor működik offline, ha a Google terékép alkalmazáson kersztül a célterületet letöltjük offline használatra.
Azokat a szervereket listázza ki a mobil alkalmazás, amelyek regisztrálva vannak az https://openbiomaps.org/projects/openbiomaps_network adatbázisban.
Hol található meg az OpenBioMaps R csomag?¶
Egyelőre csak fejlesztői csomagként érhető el itt: https://github.com/OpenBioMaps/obm.r.
Milyen adat letöltési lehetőségek vannak?¶
Csv, kml, json és egyéb modulok használatával, ha ezek rendelkezésre állnak
QGIS-en keresztül
Könyvjelzők és állandó hivatkozások használatával
Az R csomag használatával